Age of Empires 3 Hikayesi
Her üç bölümde de Amelia Black (Tasia Valenza) tarafından anlatılıyor var olan hikaye. Oyuncu, standart uygarlıklardan biri olarak oynamak yerine, her kuralın tasvir ettiği karakter veya dönemle bağlantılı özel uygarlıkları kontrol ediyor I. blüm için St. John Şövalyeleri, II. bölüm için John Black'in Paralı Askerleri ve III. bölüm için de Birleşik Devletler sunulur. Birçok birim İngilizce konuşur.
16. yüzyılın sonlarında, Saint John Şövalyeleri'nin İskoç komutanı Morgan Black, Malta'daki son kalelerini Osmanlı İmparatorluğu'nun Şahin güçlerinden koruyor. Türkler kaçtığında, Morgan ve üstü Alain Magnan, Ay Gölü'nü anlatan bir taş kütüphane keşfeder; Ebedi hayatın rivayet edilen bir kaynağı olan Gençlik Çeşmesi; ve Çeşme'yi kendi çıkarları için arayan Ossus Çemberi adlı gizli bir topluluk bulunur. Alain, Morgan'a Gölü aramak için Yeni Dünya'ya yelken açmasını emreder, ancak Morgan korsan Elisabet Lizzie Ramsey tarafından saldırıya uğrar ve Karayip adalarına iner.
Birinci Bölüm
Lizzie'ye yeniden katılıp onu yendikten sonra, Morgan'ın adamları bazı navigasyon çizelgeleri bulur ve Yeni İspanya'ya yelken açar. Yucatan'da Morgan'ın kuvvetleri bir Osmanlı üssünü yok eder. Ancak İspanyol fatih Francisco Juan Delgado de Leon, Şahin'i ele geçirir. Morgan daha sonra yeni Aztek müttefiklerini İspanyollardan korur ve Delgado'nun kasaba meydanı mozaiği kılığında Ay Gölü haritasını aradığını öğrenir. Morgan, Florida'ya yelken açar, ancak filosu bir kasırga tarafından hasar görür ve Lizzie'nin saygısını kazandığı Havana, Küba'ya demirler ve Lizzie'yi Florida'ya götürürse İspanyol hazine filosundan ona altın sözü verir.
Florida'da, Alain gölünü talep ederken, Morgan ve Lizzie, İspanyol hazine gemilerini ve Şahin'i ele geçirerek bu süreçte Delgado'yu öldürür. Şahin, Morgan'a sadece Çember'in Çeşme'yi talep etmesini engellemek istediğini söyler. Alain, Morgan'a Şahin'i idam etmesini emreder, ancak Şahin ve Lizzie, Morgan'ı Alain'in Ossus Çemberi'ne gerçekten liderlik ettiğine ikna eder. Ay Gölü'nde grup, Çember'den Sabit Silah adı verilen devasa bir topu ele geçirir. Sabit Silahı kullanarak, Lizzie'nin ateş gemileri ve Morgan'ın kara kuvvetleri, Çember'in seçkin Kemik Muhafız askerlerini uzak tutar, Alain'i öldürür ve Çeşme'yi yok eder.
Savaştan sonra Şahin, Türkiye'ye döner ve İspanyol altınını kaybeden Lizzie, Morgan'la yeniden bir araya geleceği ima edilse de Karayipler'e gider. Morgan sessizce Gençlik Çeşmesi'ni gerçekten bulup bulmadıklarını merak eder, sonra boş şişesini gölden, değerli suyla doldururken görünüyor.
İkinci Bölüm
18. yüzyılın ortalarında, Morgan'ın torunu John Black, Mohawk arkadaşı Kanyenke ve paralı askerleri, John'un amcası Stuart Black tarafından Brunswick kolonisini Cherokee akıncılarına karşı savunmak için çağrılır. Koloniyi kurtardıktan sonra, John ve Kanyenke Cherokee, savaş kamplarına saldırır ve Cherokee'yi ateşkes düzenlemeye zorlar. John, Kanyenke ve koloninin garnizonunu müzakere ederken, İngiliz General Warwick onlara saldırmak ve Brunswick'i ele geçirmek için bir orduya liderlik ediyor.
John ve Kanyenke, Brunswick'i kurtarmak için geri dönerler ancak Warwick'in Stuart'ı kaçırdığını öğrenirler. John, Ossus Çemberinin geri döndüğü sonucuna varır. Kanyenke, kız kardeşi Nonahkee'nin tehlikede olabileceğine inandığından New England'a giderler. Warwick'i John'un yerini öğrenmeyi umarak Nonahkee'nin köyüne saldırırken bulurlar. Sonraki savaştan sonra John, Kanyenke'ye kendisinin ve Nonahkee'nin aşık olduğunu açıklar.
John ve Kanyenke, Warwick'e karşı savaşmaya devam etmek için Yedi Yıl Savaşı'nda çok geçmeden Fransızlarla ittifak kurar. Albay George Washington onlara Warwick'in bir dönek olduğunu ve İngilizlerden olduğunu söylediğinde, John onu takip etmelerine yardım etmeyi kabul eder. John'un paralı askerleri ve Washington'un güçleri, John'un Stuart'ın kafası kesilmiş cesedini bulduğu Great Lakes bölgesindeki Warwick'in üssünü yok eder. John ve Kanyenke, Warwick'i Rocky Dağları'na kadar takip etmeye devam ederler ve burada Warwick'in tedarik trenini durdururlar ve müstahkem bir Çember üssünü yok ederler.
Warwick ve askerleri daha da batıya, Colorado'ya kaçarlar. John ve Kanyenke savaşırken, İngiliz ve Fransız kolonilerini ve kasabalarını ele geçirmeyi ve nihayetinde Kuzey Amerika'yı ele geçirmeyi planladığını keşfeder. John, Warwick'in peşine düşerken, Kanyenke ve bazı madenciler Rus topçularının ilerlemesini durdurmak için kaya köprülerini yıkıyorlar. Warwick, yerleştirdiği patlayıcıları patlatan John'u pusuya düşürüp, Rusları ve Çember'in birliklerini bir çığa gömerken, paralı askerler de doğuya dönüyorlar. İlkbaharda, Kanyenke köyüne döner ve Nonahkee'nin John'un oğlu Nathaniel'e annelik ettiğini öğrenir.
Üçüncü Bölüm
1817 senesinde Nathaniel'in kızı ve bir Amerikan demiryolu şirketi olan The Falcon Company'nin mirasçısı Amelia Black, John'un ölümü için İngilizler ve Amerikalılar tarafından verilen tazminatı tükettikten sonra operasyonlarını genişletmeye çalışıyor. Amelia, Meksika sınırına yakın ABD Süvarilerini tedarik etmek için iz bıraktıktan sonra, kendisine ve Binbaşı Ryan Cooper'ın bir kaleye saldıran Meksika ordusunu yenmesine yardım eden Fransız arayıcı Pierre Beaumont ile tanışır. Beaumont, Amelia'yı Colorado madenine götürür; Kanyenke, Amelia'yı Beaumont'un artık Ossus Çemberi'ne liderlik ettiği konusunda uyarmak için gelir.
Amelia, Kanyenke ve Cooper, Beaumont'u madenlerde kovalar ve Ay Gölü'nün bir haritasını bulur. Gölde, üçü bir düşmen üssünü yok eder, ardından Beaumont'un kurtlarından biri Cooper'ı öldürür. Şimdi Cooper'ın intikamını almak isteyen Amelia, yerel Seminolelerden Pacamayo Vadisi'ndeki bir İnka şehrinin Çeşme'nin suyundan birkaç varil barındırdığını öğrenir.
Amelia ve Kanyenke, Güney Amerika'ya yelken açar ve Simón Bolívar'ın İspanyolları yenmesine yardım eder. Bolivar onlara rehberler sunar ve Çember'in ordusu peşlerindeyken And Dağları'ndan tehlikeli bir geçiş yaparlar. Pacamayo Vadisi'ndeki İnka şehrini keşfederler ve onu Çember'den korurlar. Amelia kısa süre sonra Beaumont'un bir kez daha, bu sefer Çeşme suyunun fıçılarıyla kaçtığını öğrenir. Amelia ve Kanyenke, Küba'daki son kaleleri Ossuary'de Çember ile savaşırlar.
Havana'nın yardımıyla Ossuary'yi yok ettikten sonra Beaumont, Amelia ve Kanyenke'yi pusuya düşürür, ancak Amelia onu vurur ve öldürür. Daha sonra Falcon şirketini canlandırmak için Çember'in depolanan hazinesini kullanır ve Amerika Birleşik Devletleri'nin gelecekteki batı kıyısına demiryolları inşa eder. ABD'de yaşlı bir adam, Amelia'yı tebrik eder, onun Morgan Black olduğunu ve Gençlik Çeşmesi'nden su kullanarak ömrünü büyük ölçüde uzattığını ima eder.